La Radioteràpia estereotàxica fraccionada permet administrar una dosis encara més gran de radiació a les lesions cerebrals, preservant-ne encara més l'estructura i funció de les cél·lules normals veïnes, ja que s'efectua administrant una dosi molt petita per fracció que es incapaç de produir lesions als teixits sans però que s'acumula en el teixits patològics, amb el que s'evita encara més l'aparició de seqüeles o complicacions. S'efectua principalment quan la lesió està molt propera a estructures especialment crítiques tal com el tronc del encèfal, el quiasma, els nervis òptics o la glàndula hipòfisi. Gràcies a l'ús del sistema de reposicionament n-Track (TM) i el guiat mitjançant la impressió dental i les radiocàmeres de infrarojos, la col·locació de cada dia per a la sessió de tractament és ràpida, còmoda i molt precisa.

Cada sessió de tractament s'administra amb la tècnica de IMRT, en la qual no solament la forma del camp de irradiació s'adapta a la forma del tumor amb una precisió millor de 0,1 mm sinó que, ademés, la intensitat del feix d'irradiació en cada camp es variable, adaptant-se a las característiques anatòmiques del tumor i de las estructures normals.

En resum, amb la radioteràpia estereotàxica fraccionada, tenim la mateixa precisió que mitjançant la radiocirurgía estereotàxica, però una major protecció biològica de las estructures crítiques.